玩家获取船只的主要方式是在港口船坞建造运输船，这需要提前在港口船坞里建造足够的运输船，并升级海军基地等级以解锁更大运载量的高级船只。燃油储备也需要在出发前检查是否充足，以避免长途航行中燃油耗尽，而精英船只的获取则主要通过占领高级港口并完成特定任务实现，港口占领后的建造环节直接影响船只品质。
部队登船时，需要将地面部队移动到港口附近，然后直接选中地面部队，点击操作界面里的装载指令，再指定要搭乘的运输船即可完成装载。装船时应注意兵种搭配，避免将所有重型装备或步兵集中在一艘船上，以减少被击沉时的损失风险，同时运输船本身没有战斗力，最好安排巡洋舰等舰船进行贴身护航以确保安全。
在运输船管理页面，玩家可以确认载货类型，包括弹药、燃料、食物等战略物资，并严格控制在船只容量范围内。航线规划需避开敌方控制区或高危海域，可通过长按地图设定路径点实现迂回前进，以降低被拦截的概率，安全路线规划对于减少遭遇敌方袭击至关重要。
运输船抵达目标港口后，卸货过程会自动触发，无需手动操作，但卸货成功率受目的地安全状态影响，如果港口被敌方占领或遭袭，任务将被迫中断。卸货期间运输船处于无防御状态，建议选择夜间或恶劣天气执行任务以降低被发现概率，卸货完成后船只自动返回出发港口，可立即投入下一次运输任务。
为确保运输过程的安全，建议派遣护航舰队或侦察机进行保护，遭遇敌方拦截时及时调整路线或请求支援。运输船的升级与强化也能提升后勤效率，通过科技研发可提升船只载重量、航行速度及装甲防护，部分高级型号还配备防空武器，多艘运输船组成编队时建议分散航线以避免全军覆没的风险。
