提升船只防御能力的核心在于合理选择船型、强化装备配置、优化兵种搭配以及掌握水战指挥技巧。蒙冲、斗舰和楼船三种基础船型各具特点，其中楼船耐久度最高但速度较慢，适合作为防御核心；斗舰攻防均衡，是常规水战的主力选择；蒙冲速度快但载员少，更适合突袭而非正面防御。船只等级提升会直接增加耐久度和舱室容量，每升一级可提高防御基础属性，因此优先将主力防御船只升至当前最高等级是基本策略。
战舰装备强化是提升防御的关键环节，通过铁匠铺打造的防御型装备能显著增强船只抗打击能力。重点强化船体装甲部件可减少受到的兵刃伤害，而配备特殊防御道具如龙骨能有效降低火攻伤害。帅令坛升级后可为船只提供额外统御值加成，使高统御值防御武将能够上阵。不同品质的装备对防御提升幅度差异较大，S级装备往往带有先民插槽，能安装特殊防御插件，这是后期提升船只生存能力的重要途径。
兵种搭配方面，水军防御阵容建议以藤甲兵为核心，配合具有恢复能力的辅助兵种。藤甲兵能大幅减免普通攻击伤害，但需注意规避火攻战术。合理利用兵种克制关系，在面对弓兵为主的敌方舰队时，可配置更多步兵单位进行反制。武将技能选择上，草船借箭和暂避其锋等防御型指挥战法能有效保护舰队，其触发率高于单体治疗技能，适合群体防御场景。美人计策略中的防御加成效果也不容忽视，特定美人属性可激活船只隐藏防御属性。
水战指挥技巧对防御效能影响显著，分散包围战术能避免舰队集中承受伤害，而及时调整阵型进行攻防转换尤为关键。当处于防守态势时，建议采用圆形防御阵型，配合箭塔等城防设施形成交叉火力。特殊事件处理方面，剧本中的风向变化会影响火攻效果，需提前做好应对预案。同盟合作防御时，统一指挥调度和防御设施协同布置能产生1+1>2的效果，多人联防体系下船只生存率会显著提升。
科技研究对船只防御有深远影响，优先升级军事类科技中的船体加固和水军训练分支，能同时提升基础防御属性和特殊状态抗性。分城建设中的军机营等级决定了可建造防御设施的数量，建议至少提升至2级以保障基础防御需求。资源分配方面，木材和铁矿是船只防御强化的主要消耗材料，需要保持稳定产出。后期通过功勋商店兑换的专属防御道具往往具有独特效果，这是高端局提升防御能力的有效补充手段。
防御策略需要根据战场形势动态调整，过度侧重防御可能导致输出不足。理想状态是建立攻防一体的舰队体系，在保证基础生存能力的前提下兼顾战术灵活性。侦查系统提供的敌军信息能帮助预判攻击方向，从而针对性加强特定区域的防御部署。船只防御能力的提升是一个系统工程，需要武将、装备、兵种、科技等多方面协同发展，任何单一方面的极致强化都难以应对复杂多变的水战环境。
