血缘关系是人口增长的核心机制之一，但其设定存在严格限制。游戏明确禁止近亲交配，居民配对时若检测到血缘关系，对话会显示nothing或with family等提示，无法触发后续的生育行为。这种设计避免了基因单一性，同时增加了人口管理的策略性。血缘判定不仅影响配对效率，也间接影响避难所的整体人口质量，需通过合理分配起居室和居民来规避亲属冲突。
血缘关系的另一个特点是遗传属性的随机性。父母双方的等级、品质和属性并不完全决定后代属性，但统计显示子女的最高属性有较大概率继承父母中的较高值。同一对父母可能生出属性分布完全不同的后代，这种随机性使得玩家无法通过固定组合批量生产高属性居民，必须结合训练室逐步培养。初始属性总和固定的设定让低属性父母的后代仍有提升空间，但需投入更多训练时间。
当避难所人口接近上限时，生育行为会被强制中断，孕妇将显示难产状态，必须扩建起居室才能完成分娩。由于游戏没有寿命设定，同一对居民可无限次生育，但需注意亲属密度过高会导致后续配对效率下降。建议单独设置专用配对房间，将非亲属居民集中管理，既能提高生育效率，也能避免因血缘检测导致的资源浪费。
血缘机制还影响特殊事件的处理效率。怀孕居民无法参与灾害防御，遇到火灾、蟑螂入侵等事件时会自动躲避至起居室，若亲属集中居住可能导致多个房间无人值守。高难度玩法中需将孕妇分散安置在生产类房间，利用工作间隙完成生育，同时确保其他区域有足够战力应对突发事件。这种设计迫使玩家在人口增长与避难所安全之间寻找平衡。
血缘系统通过禁止近亲繁殖、随机遗传属性和容量限制等设定，将人口管理转化为资源调配与长期规划问题。玩家需综合考量起居室布局、居民属性训练和灾害防御等多重因素，才能高效利用这一机制实现避难所的可持续发展。
